蜀有重重天险可以御守，吴有三江阻隔可为屏障，将这两个长处合起来，共为唇齿之邦，进可并吞天下，退可鼎足三分，这是很自然的道理。大王您如今如果去投靠魏国，魏国必定首先要求您去朝拜，继而想要您的太子进朝作人质，如果您不从命，他们就有了借口进兵前来讨伐，那样蜀国也必定会随势顺流而见机行事。这样一来，江南的江山恐怕不再为大王的国土了!”孙权沉默良久说：“您所言极是。”于是自动与魏国绝交，而与蜀国联和，派遣张温回访蜀国。蜀国再派邓芝前往东吴，孙权对邓芝说：“如果天下太平了，二主分治天下，该是多么令人高兴的事!”邓芝回答说：“天无二日，地无二主，如果并吞魏国之后，大王您也不知道天命把天下许赐给谁。为君者各自去光大自己的仁德，为臣者各自尽自己的忠心，而身为将领之人则握拿鼓棰擂鼓，争战才刚刚开始。”孙权大笑说：“您确实诚实。”孙权在给诸葛亮的信中说：“丁瞇浅薄艳饰，阴险不诚，使两国合和结好只有邓芝一人。”及至诸葛亮北往驻守汉中，以邓芝为中监军、扬武将军。诸葛亮逝世后，邓芝被升为前军师前将军，兼兖州刺史，被封为阳武亭侯，不久又作江州都督。孙权多次与邓芝互致问候，他给予邓芝很丰厚的馈赠。

延熙六年(243)，邓芝被就地升任为车骑将军，后又获假节。延熙十一年(248)，涪陵属国有人杀死都尉反叛，邓芝率军征讨，很快将其首领斩杀，使百姓安居。延熙十四年(251)，邓芝逝世。邓芝任大将军二十余年，赏罚分明，抚爱军士，自身的衣、食都靠公家供应，生活朴素俭节，终生不积蓄产业，家属也不免连带受饥寒，去世时家中没有任何过剩的财产。他性格刚强质朴，不掩饰自己的情绪，因而与同僚们关系很不和谐。当时的人很少有受他敬重者，唯独器重姜维。邓芝之子邓良，承袭邓芝的爵位，景耀年间，为尚书左选郎，后为晋朝的广汉太守。